ThirdBrain

노트를 모순 없는 지식 그래프로 바꾸고, 그 그래프로 문제를 푼다.

ThirdBrain은 글에서 명제를 추출하고, 논리적으로 유형화된 엣지로 지식 그래프를 구축하며, 모순을 감지하고, 그 그래프 위에서 문제를 푸는 Obsidian 플러그인입니다 — 모두 로컬에서, 원하는 AI 제공자로.

마스코트 Curioso를 소개합니다. 텍스트를 먹여주면 지식 유기체로 자랍니다.

목차

1. 1분 요약
2. 설치
3. AI 제공자 설정
4. 핵심 개념
5. 화면 구성
6. 워크플로우 ① 그래프 생성 (인제스트)
7. 워크플로우 ② 뇌 상태
8. 워크플로우 ③ 미션 컨트롤 (폴더 RAG 작업대)
9. 워크플로우 ④ 폴더 분석
10. 워크플로우 ⑤ 그래프 보기
11. AI 비용 확인 게이트
12. 저장 구조
13. 설정
14. 커맨드
15. 자주 묻는 질문
16. 엔터프라이즈 활용
17. 요구 사항 · 라이선스

1분 요약

1. 리본의 Curioso 아이콘을 눌러 ThirdBrain 패널을 엽니다.
2. 회의록·문서·대화 텍스트를 붙여넣거나 파일을 드롭하고 ✦ 그래프 추출 → 명제·엣지·문제로 분해된 그래프가 만들어집니다.
3. Curioso를 클릭하면 뇌 상태가 열립니다 — 폴더별로 아직 안 끝난 미션·미연결 명제·모순을 처리합니다.
4. 🎯 미션 컨트롤 에서 쌓인 그래프를 근거로 삼아 대화형으로 문제를 풉니다 (모든 답이 [[노드]]로 역추적).
5. 🔍 폴더 분석 으로 종합 인사이트를, ⊕ 그래프 보기 로 시각화를 얻습니다.

AI 작업 전에는 항상 예상 토큰·비용·시간 확인 창이 뜹니다 (설정에서 끌 수 있음).

설치

• 커뮤니티 플러그인(권장): Obsidian → 설정 → 커뮤니티 플러그인 → 탐색 → ThirdBrain 검색 → 설치·활성화
• 수동: 릴리즈에서 main.js·manifest.json·styles.css 다운로드 → {볼트}/.obsidian/plugins/thirdbrain/에 복사 → 활성화

AI 제공자 설정

ThirdBrain은 네 가지 백엔드를 지원합니다. 최초 실행 시 온보딩에서, 또는 설정 → ThirdBrain에서 선택합니다.

모든 AI 호출은 사용자 기기에서 직접 이루어집니다. ThirdBrain 서버로 데이터가 전송되지 않습니다. Claude Code(CLI) 모드는 로컬 서브프로세스를 실행하므로 데스크톱에서만 동작합니다. API 모드(Gemini/Claude API/GPT)는 Obsidian 내장 네트워크로 모바일에서도 동작합니다.

핵심 개념

• 명제(proposition): 원문 한 구절에 고정된 원자적 주장. 모든 명제는 자기가 나온 원문 구절(source_span) 을 기억합니다.

• 엣지(edge): 명제 사이의 유형화된 논리 관계. 아래 4축 10종만 허용되며, 각 엣지는 근거(axiom_basis)를 반드시 인용합니다.

  축	관계
  인과·전제	causes · precedes · precondition_of
  진리·증명	supports · conflicts_with · contrasts_with
  계층·적용	exemplifies · applies_to
  위상 교차	analogous_to · isomorphic_to

• 문맥(context/토픽): 명제들이 소속되는 주제 묶음. 논리 엣지가 아니라 소속(membership) 필드로 관리됩니다.

• 액션(action): 토픽 내 명제들을 종합해 도출된 실행 태스크. _actions/에 저장.

• 문제(problem) = 미션: 의도와 현실 사이의 긴장(장애·공백·리스크) 또는 승격된 모순. _problems/에 저장되고 open → resolved 라이프사이클을 가집니다.

• 원본 격리(raw): 넣은 원본은 raw/에 그대로 박제되고, 모든 명제가 위키링크로 원문 구절까지 역추적됩니다.

화면 구성

패널 위에서 아래로:

• 헤더: 로고 · 부제 · 세션 사용량 표시줄
• Curioso 드롭존 (Curioso는 ThirdBrain의 마스코트입니다): .md / .txt / .pdf / .mp3 먹여주세요
  • 드래그해서 밥 주기 = 인제스트(파일 로드)
  • Curioso 클릭 = 뇌 상태 열기
  • 미해소 모순이 있으면 Curioso에 빨간 ! 말풍선이 떠, 클릭하면 뇌 상태로 이동
  • 📁 파일 선택 버튼 / 텍스트 입력창 / 글자 수
• 버튼 4개

  버튼	기능
  ✦ 그래프 추출	입력한 텍스트를 그래프로 생성(파이프라인 실행)
  🔍 폴더 분석	폴더 종합 인사이트 + 전사본(표현) 분석
  ⊕ 그래프 보기	네이티브/캔버스 그래프 · 내보내기 · 삭제
  🎯 미션 컨트롤	폴더 그래프를 근거로 문제를 푸는 대화형 작업대

• 파일 수 표시

워크플로우 ① 그래프 생성 (인제스트)

가장 기본이 되는 흐름입니다.

1. 입력: 텍스트를 붙여넣거나, .md/.txt/.pdf/.mp3를 Curioso에 드롭(또는 📁 파일 선택).

   • PDF는 자동으로 텍스트 추출.
   • MP3는 OpenAI(Whisper)로 전사 → 화자 분리 → 제목 추론 (OpenAI 제공자 + 키 필요).

2. ✦ 그래프 추출 클릭.

3. 콘텐츠 타입 선택: 문서 / 강의 / 회의 / 대화.

   • 회의는 하위 유형(브레인스토밍·실행·리뷰)에서 액션 레이어가 함께 도출됩니다.
   • 대화는 하위 유형(영어회화·통화·인터뷰).

4. 저장 폴더 선택: 루트 하위에서 고르거나 새 폴더 생성.

5. AI 비용 확인 창: 예상 토큰·비용·시간을 보고 진행을 눌러야 실행됩니다. (취소하면 입력이 보존됩니다.)

6. 파이프라인 실행 (진행바 + 스텝 로그):

   단계	하는 일
   원본 박제	원본을 raw/에 저장
   문맥	핵심 주제·개념 추출
   명제	원문 구절에 고정된 원자적 주장 추출
   엣지	4축 10관계 논리 엣지 생성(근거 인용 필수)
   액션(선택)	토픽별 복합 실행 태스크 도출 → _actions/
   문제	의도·현실의 긴장 감지 → _problems/
   자동 연결	기존 그래프와의 연결 스캔 (신뢰도 ≥75% 자동 저장, 그 미만은 칩으로 제시)
   나이브 요약	원문 전체를 산문 그대로 요약 → summaries/ (구조화에서 놓친 뉘앙스 보완)

7. 결과 패널: 문맥·명제·논리·액션·문제 레이어가 카드로 표시됩니다.

   • 모순이 감지되면 결과 상단에 알림이 뜨고, 해소는 뇌 상태에서 진행합니다.

큰 텍스트는 자동으로 청크 분할되어 순차 처리되며, 중간에 끊겨도 완료된 청크는 보존됩니다.

워크플로우 ② 뇌 상태

Curioso를 클릭하면 열립니다. 미션·미연결·모순은 볼트 전역 경보가 아니라 "폴더 안에서 아직 안 끝난 일" 이므로, 폴더 단위로 드릴인해서 처리합니다.

Level 1 — 폴더 목록

미션·미연결·모순이 하나라도 있는 폴더가 배지와 함께 나열됩니다.

📁 7월_기획회의      ⚠ 모순 1   🎯 미션 2   ◈ 미연결 3
📁 리서치_노트                   🎯 미션 1

폴더를 클릭 → 상세로 진입.

Level 2 — 폴더 상세

• ⚠ 미해소 모순: 각 모순 카드의 해소하기 → 모순 해소 모달. 세 옵션:
  1. 엣지 재분류 — AI가 더 정확한 관계(예: contrasts_with)를 추천, 클릭 시 교체
  2. 상위 전제 추가 — 두 모순을 포괄하는 상위 개념 노트를 만들어 precondition_of로 연결 (AI 제목 추론 지원)
  3. 한쪽 폐기 — 거짓으로 판별한 명제 삭제
  • 어떤 방식이든 어떻게 해소했는지가 문제 노드에 기록됩니다.
• 🎯 미션: 각 미션 카드에서
  • 🎯 작업대 — 해당 폴더·미션으로 미션 컨트롤 진입
  • 내용 — 미션 서술 + 증거 원문(위키링크 클릭 가능) 열람
  • 해소 — 미션을 resolved 처리
• ◈ 미연결 명제: 연결하기 (AI 린팅) → 같은 폴더 안에서 AI가 연결 후보를 찾아 제시. 후보마다 대상 노드·관계·신뢰도·근거가 표시되고, 수락하면 엣지가 저장됩니다.

워크플로우 ③ 미션 컨트롤 (폴더 RAG 작업대)

🎯 미션 컨트롤 버튼, 또는 뇌 상태의 미션 🎯 작업대로 진입합니다. 쌓인 그래프로 문제를 푸는 메인 기능입니다. 일반 챗봇과 달리 답의 출처가 증발하지 않습니다 — 모든 답이 실존하는 [[노드]]로 역추적 보장됩니다.

Level 1 — 폴더 선택

폴더별 열린 미션 수·노드 수를 보고 작업할 폴더를 고릅니다. 하단의 폴더 간 연결 탐색 보조 버튼으로 두 폴더 사이의 구조적 브릿지(크로스 도메인 연결·모순)를 찾을 수도 있습니다.

Level 2 — 작업대

• 헤더: 폴더명 · 그라운딩 노드 수 · 세션 누적 토큰
• 미션 리스트: 그 폴더의 열린 문제들. 미션을 고르면 그 미션 기준으로 대화가 이어집니다.
• 채팅: 질문을 입력하면 폴더 그래프(문맥·명제·액션·논리엣지·raw)를 근거로 답합니다.
  • 답변의 [[노드]] 인용은 실존 검증되며, 없는 노드를 지어내면 취소선·경고로 표시됩니다.
  • 근거가 없으면 "근거 없음"이라고 답하도록 강제됩니다.
• 서브그래프 참여: 다른 폴더의 그래프를 참고인으로 잠시 끌어올 수 있습니다. 참여 중인 서브그래프는 칩으로 표시되고 ✕로 해제합니다. 서브그래프 출신 인용은 [[노드]] (from: 폴더명)으로 출신이 병기됩니다.
• 미션 승격: 대화 중 발견한 문제를 문제 노드로 승격(장애/공백/리스크 분류 + 증거 노드 선택 → _problems/ 저장).
• 대화 박제: 문답이 _solving/ 노트에 마크다운으로 기록됩니다. 미션 기반이면 해당 미션 노트에 이어쓰기, 자유 채팅이면 작업대-{폴더}-{날짜}.md.

비용 게이트는 세션 첫 질문에 1회만 뜨고, 이후 턴은 비게이트로 진행됩니다.

워크플로우 ④ 폴더 분석

🔍 폴더 분석 — 두 개의 탭.

그래프 분석 탭

폴더를 선택하고, 분석 목적(핵심 파악·논리 구조·모순 탐지·발표용·의사결정 등) 프리셋을 고르거나 직접 입력한 뒤 깊이(요약/심층)를 선택합니다. _actions 하위 포함 여부도 선택할 수 있습니다. 결과는 종합 결론 + 개요 + 주요 통찰 + 주제 묶음 + 연결 맥락으로 구성된 리포트이며, 저장할 수 있습니다.

표현/전사본 분석 탭

폴더 노드를 대상으로 언어·정보·지시·문단 관점의 분석을 수행합니다. 백그라운드로 돌아 모달을 닫아도 계속 실행되며, 결과를 폴더에 저장할 수 있습니다.

워크플로우 ⑤ 그래프 보기

⊕ 그래프 보기 — 네 개의 탭.

AI 비용 확인 게이트

사용자가 직접 시작하는 모든 AI 작업(생성·폴더 분석·미션 컨트롤 첫 질문·전사본 분석·고립 린팅·음성 전사) 전에 확인 창이 뜹니다.

• 표시: 예상 호출 수 · 예상 토큰(입력/출력) · 예상 비용(USD) · 예상 시간
• 진행을 눌러야 실행, 취소 시 실행하지 않음(생성은 입력 보존).
• Claude CLI는 구독 사용량에서 차감되므로 비용은 API 환산 참고치로 표시됩니다.
• 값은 추정치입니다(실제 사용량과 다를 수 있음).
• 화면 열 때 딸려오는 소량 자동 호출은 게이트하지 않습니다.
• 끄기: 설정 → ThirdBrain → "AI 실행 전 비용 확인" 토글.

저장 구조

루트 폴더(기본 ThirdBrainRoot) 아래 세션(주제)별로 정리됩니다.

ThirdBrainRoot/
├─ raw/                     원본 박제(허브-스포크 위키링크)
├─ summaries/               나이브 산문 요약
└─ {세션}/
   ├─ {명제·문맥 노드}.md
   ├─ _actions/             실행 태스크
   ├─ _problems/            문제(미션) 노드
   └─ _solving/             작업대 대화 기록

각 노드 .md의 프론트매터: tb_id · tb_type · tb_edges · tb_tags · tb_source_span · tb_axiom_basis 등. 엣지는 위키링크로도 저장되어 Obsidian 네이티브 그래프가 관계를 렌더합니다.

설정

설정 → ThirdBrain:

• 언어 (한국어/English) — UI와 AI 출력 언어
• AI 실행 전 비용 확인 — 게이트 on/off (기본 on)
• 루트 폴더 — 모든 ThirdBrain 파일의 최상위 폴더
• Claude CLI 경로 (데스크톱) — claude 또는 절대 경로
• AI 제공자 + 각 제공자 API 키

커맨드

• ThirdBrain: Open panel — 패널 열기
• ThirdBrain: Open mission workbench (active problem note) — 현재 연 문제 노트의 작업대를 바로 열기

자주 묻는 질문

Q. 모순이 생기면 어떻게 되나요? 새 명제가 기존 지식과 충돌하면 즉시 conflicts_with 엣지로 표시되고 문제 노드로 승격됩니다. Curioso의 빨간 !로 알림이 오며, 뇌 상태에서 세 옵션(재분류·상위 전제·폐기)으로 해소합니다. 어떤 모순도 조용히 묻히지 않습니다.

Q. 미션 컨트롤이 일반 챗봇과 뭐가 다른가요? 답이 반드시 폴더 그래프에 그라운딩되고 실존 [[노드]]로 인용되어야 합니다. 근거가 없으면 지어내지 않고 "근거 없음"이라고 답합니다 — 출처가 증발하지 않는 것이 핵심입니다.

Q. 넣은 원문은 안전한가요? 원본은 raw/에 그대로 보존되고, 모든 명제가 원문 구절까지 역추적됩니다. 그래프 삭제도 영구 삭제가 아니라 휴지통 이동(복구 가능)입니다.

Q. 비용이 걱정됩니다. 모든 사용자 시작 AI 작업 전에 예상 토큰·비용·시간이 표시되고, 진행을 눌러야 실행됩니다. 작은 테스트 텍스트로 먼저 감을 잡는 것을 권합니다.

Q. 모바일에서 되나요? API 제공자(Gemini/Claude API/GPT)를 쓰면 모바일에서도 동작합니다. Claude Code(CLI) 모드는 데스크톱 전용입니다.

엔터프라이즈 활용

ThirdBrain의 아키텍처 — 유형화된 논리 엣지, 완전한 출처 역추적, 모순 감지 — 는 조직의 고위험 문제에 그대로 적용됩니다.

• 아이디어에서 코드까지 완전한 역추적: 제품 기획서·도메인 문서를 넣으면 raw/에 보존되고, 정확한 출처 구절과 함께 명제로 해체되며, 이를 구현하는 개발 액션과 동기 링크로 연결됩니다. 동기 링크가 감사 추적이 됩니다.
• 시맨틱 콜라이더: 두 도메인의 문서를 각각 다른 폴더에 인제스트한 뒤 폴더 브릿지(미션 컨트롤 → 폴더 간 연결 탐색)를 실행하세요. conflicts_with 엣지가 코드를 쓰기 전에 충돌 지점을 드러냅니다.
• 논리적 API 게이트키퍼: 핵심 결정으로 마스터 그래프를 구축하세요. 새 요청을 인제스트했을 때 마스터 그래프와 conflicts_with가 생기면 정확히 어떤 명제와 충돌하는지 제시하고 해소를 요구합니다 — 소모전이 아니라 논리로.

요구 사항 · 라이선스

• Obsidian 1.7.2 이상
• 다음 중 하나: Gemini API 키, Anthropic API 키, OpenAI API 키, 또는 Claude Code CLI (데스크톱)

MIT

ThirdBrain — English

Turn your notes into a contradiction-free knowledge graph — then solve problems with it.

ThirdBrain is an Obsidian plugin that extracts propositions from your writing, builds a logical knowledge graph with typed edges, detects contradictions, and lets you solve problems on top of the graph — all locally with your choice of AI provider.

Meet Curioso, the ThirdBrain mascot. You feed it text; it grows a knowledge organism.

Table of Contents

1. Quick Start
2. Installation
3. AI Provider Setup
4. Core Concepts
5. Panel Layout
6. Workflow ① Graph Generation (Ingest)
7. Workflow ② Brain Status
8. Workflow ③ Mission Control (Folder RAG Workbench)
9. Workflow ④ Folder Analysis
10. Workflow ⑤ Graph View
11. AI Cost Preflight Gate
12. Storage Structure
13. Settings
14. Commands
15. FAQ
16. Enterprise Use Cases
17. Requirements & License

Quick Start

1. Click the Curioso icon in the ribbon to open the ThirdBrain panel.
2. Paste meeting notes, a document, or a dialogue — or drop a file — and click ✦ Extract Graph. You get a graph decomposed into propositions, typed edges, and problems.
3. Click Curioso to open Brain Status — resolve each folder's open missions, unlinked propositions, and contradictions.
4. Open 🎯 Mission Control to solve problems conversationally, grounded in your accumulated graph (every answer is traceable to real [[nodes]]).
5. Use 🔍 Folder Analysis for synthesized insight and ⊕ Graph View for visualization.

Before any AI operation, a token / cost / time confirmation dialog appears (can be disabled in settings).

Installation

• Community Plugins (recommended): Obsidian → Settings → Community plugins → Browse → search ThirdBrain → Install & Enable.
• Manual: Download main.js, manifest.json, styles.css from the latest release → copy to {vault}/.obsidian/plugins/thirdbrain/ → enable.

AI Provider Setup

ThirdBrain supports four backends. Choose one during onboarding or in Settings → ThirdBrain.

All AI calls run locally from your machine. No data is sent to any ThirdBrain server. Claude Code (CLI) mode spawns a local subprocess, so it is desktop-only. API modes (Gemini / Claude API / GPT) work on mobile through Obsidian's built-in networking.

Core Concepts

• Proposition — an atomic claim anchored to one exact passage. Every proposition remembers the source span it came from.

• Edge — a typed logical relation between propositions. Only these 4 axes / 10 relations are allowed, and every edge must cite its grounding (axiom_basis):

  Axis	Relations
  Causal / premise	causes · precedes · precondition_of
  Truth / proof	supports · conflicts_with · contrasts_with
  Hierarchy / application	exemplifies · applies_to
  Topological	analogous_to · isomorphic_to

• Context (topic) — the theme a proposition belongs to, tracked as membership (not as a logical edge).

• Action — a composite task synthesized from a topic's propositions. Stored in _actions/.

• Problem (= Mission) — a tension between intent and reality (obstacle / gap / risk) or a promoted contradiction. Stored in _problems/ with an open → resolved lifecycle.

• Raw isolation — your original input is archived verbatim in raw/, and every proposition traces back to its exact source passage.

Panel Layout

Top to bottom:

• Header — logo · subtitle · session usage bar
• Curioso drop zone (Curioso is the ThirdBrain mascot): Drop .md / .txt / .pdf / .mp3 here
  • Drag to feed = ingest (load files)
  • Click Curioso = open Brain Status
  • If unresolved contradictions exist, Curioso shows a red ! bubble — click it to jump to Brain Status
  • 📁 Choose file button / text input / character count
• Four buttons

  Button	Function
  ✦ Extract Graph	Run the pipeline on the input text
  🔍 Folder Analysis	Synthesized folder report + transcript (expression) analysis
  ⊕ Graph View	Native / canvas graph · export · delete
  🎯 Mission Control	Conversational workbench that solves problems grounded in a folder's graph

• File count

Workflow ① Graph Generation (Ingest)

The foundational flow.

1. Input: paste text, or drop .md/.txt/.pdf/.mp3 onto Curioso (or use 📁 Choose file).

   • PDF is auto-extracted to text.
   • MP3 is transcribed via OpenAI (Whisper) → speaker separation → title inference (requires the OpenAI provider + key).

2. Click ✦ Extract Graph.

3. Choose content type: Document / Lecture / Meeting / Dialogue.

   • Meetings (subtype: brainstorm / execution / review) also derive an action layer.
   • Dialogues have subtypes (English conversation / phone call / interview).

4. Choose the save folder: pick a subfolder or create a new one.

5. AI cost confirmation: review estimated tokens / cost / time and click Proceed to run. (Cancel keeps your input.)

6. Pipeline runs (progress bar + step log):

   Stage	What it does
   Archive raw	Save the original to raw/
   Context	Extract key themes / concepts
   Propositions	Extract atomic claims anchored to source passages
   Edges	Build 4-axis / 10-relation logical edges (grounding required)
   Actions (optional)	Derive composite tasks per topic → _actions/
   Problems	Detect intent-vs-reality tensions → _problems/
   Auto-connect	Scan the existing graph for links (≥75% confidence auto-saved; the rest shown as chips)
   Naive summary	Summarize the whole source as prose → summaries/ (covers nuance the structuring may drop)

7. Result panel: context / proposition / logic / action / problem layers shown as cards.

   • If contradictions are detected, a notice appears at the top; resolve them in Brain Status.

Large text is auto-chunked and processed sequentially; if interrupted, completed chunks are preserved.

Workflow ② Brain Status

Opens when you click Curioso. Missions, unlinked propositions, and contradictions are not vault-wide alarms — they are "unfinished work inside a folder", so you drill in per folder.

Level 1 — Folder list

Folders with any mission / unlinked node / contradiction are listed with badges.

📁 Jul_Planning     ⚠ conflicts 1   🎯 missions 2   ◈ unlinked 3
📁 Research_Notes                    🎯 missions 1

Click a folder to drill in.

Level 2 — Folder detail

• ⚠ Unresolved contradictions: each card's Resolve → Conflict Resolution modal with three options:
  1. Reclassify edge — AI recommends a more accurate relation (e.g. contrasts_with); click to replace.
  2. Add parent premise — create a higher-level note that encompasses both, linked via precondition_of (AI title inference supported).
  3. Discard one — delete the proposition judged false.
  • Either way, how it was resolved is recorded on the problem node.
• 🎯 Missions: each card offers
  • 🎯 Workbench — open Mission Control for that folder + mission
  • Details — read the mission's description + evidence source text (clickable wikilinks)
  • Resolve — mark the mission resolved
• ◈ Unlinked propositions: Connect (AI lint) → AI finds connection candidates within the same folder. Each shows the target node, relation, confidence, and reasoning; accept to save the edge.

Workflow ③ Mission Control (Folder RAG Workbench)

Enter via the 🎯 Mission Control button, or a mission's 🎯 Workbench in Brain Status. This is the core feature for solving problems with your accumulated graph. Unlike a generic chatbot, the source never evaporates — every answer is guaranteed traceable to real [[nodes]].

Level 1 — Folder selection

See each folder's open-mission count and node count, and pick one to work on. The Explore folder bridges helper button finds structural bridges between two folders (cross-domain links and contradictions).

Level 2 — Workbench

• Header: folder name · number of grounding nodes · cumulative session tokens
• Mission list: the folder's open problems. Pick one to anchor the conversation to it.
• Chat: ask a question and get an answer grounded in the folder graph (context / propositions / actions / logical edges / raw).
  • [[node]] citations are verified against reality; invented nodes are struck through / warned.
  • With no grounding, the model must answer "no basis" instead of hallucinating.
• Attach subgraph: temporarily bring another folder's graph in as a witness. Attached subgraphs show as chips and can be removed with ✕. Citations from a subgraph carry their origin: [[node]] (from: folder).
• Promote to mission: turn a problem found mid-conversation into a problem node (obstacle / gap / risk + evidence node selection → saved to _problems/).
• Conversation archive: Q&A is recorded to a _solving/ note. Mission-based chats append to the mission note; free chats go to workbench-{folder}-{date}.md.

The cost gate appears once, on the first question of a session; later turns run without it.

Workflow ④ Folder Analysis

🔍 Folder Analysis — two tabs.

Graph Analysis tab

Select folders, pick an intent preset (core insight / logical structure / contradiction detection / presentation / decision, etc.) or type your own, then choose depth (summary / rich). You can include the _actions subfolder. The result is a report of synthesis + overview + key highlights + theme clusters + link contexts, and can be saved.

Expression / Transcript Analysis tab

Analyze folder nodes from language / information / directive / paragraph angles. It runs in the background (keeps going even if you close the modal) and can be saved to a folder.

Workflow ⑤ Graph View

⊕ Graph View — four tabs.

AI Cost Preflight Gate

Before every user-initiated AI operation (generation, folder analysis, Mission Control's first question, transcript analysis, orphan linting, audio transcription), a confirmation dialog appears.

• Shows: estimated calls · estimated tokens (in / out) · estimated cost (USD) · estimated time.
• You must click Proceed to run; Cancel does nothing (generation preserves your input).
• Claude CLI draws from your subscription, so its cost is shown as an API-equivalent reference.
• Values are estimates (actual usage may differ).
• Small automatic helper calls triggered by opening a view are not gated.
• Turn it off: Settings → ThirdBrain → "Confirm cost before AI runs".

Storage Structure

Under the root folder (default ThirdBrainRoot), everything is organized per session (topic).

ThirdBrainRoot/
├─ raw/                     Verbatim originals (hub-spoke wikilinks)
├─ summaries/               Naive prose summaries
└─ {session}/
   ├─ {proposition & context nodes}.md
   ├─ _actions/             Executable tasks
   ├─ _problems/            Problem (mission) nodes
   └─ _solving/             Workbench conversation logs

Each node's frontmatter: tb_id · tb_type · tb_edges · tb_tags · tb_source_span · tb_axiom_basis, etc. Edges are also stored as wikilinks so Obsidian's native graph renders the relations.

Settings

Settings → ThirdBrain:

• Language (한국어 / English) — UI and AI output language
• Confirm cost before AI runs — gate on/off (default on)
• Root folder — top-level folder for all ThirdBrain files
• Claude CLI path (desktop) — claude or an absolute path
• AI provider + each provider's API key

Commands

• ThirdBrain: Open panel — open the panel
• ThirdBrain: Open mission workbench (active problem note) — open the workbench for the currently open problem note

FAQ

What happens when a contradiction appears? A new proposition conflicting with existing knowledge is immediately flagged with a conflicts_with edge and promoted to a problem node. Curioso shows a red !; resolve it in Brain Status with three options (reclassify / parent premise / discard). No contradiction is silently buried.

How is Mission Control different from a normal chatbot? Answers must be grounded in the folder graph and cited with real [[nodes]]. With no basis, it says "no basis" instead of inventing — the source never evaporates.

Is my original text safe? Originals are preserved verbatim in raw/, and every proposition traces back to its source passage. Even graph deletion moves files to trash (recoverable), not permanent deletion.

I'm worried about cost. Every user-initiated AI operation shows estimated tokens / cost / time and requires Proceed. Try a small test text first to get a feel.

Does it work on mobile? Yes, with an API provider (Gemini / Claude API / GPT). Claude Code (CLI) mode is desktop-only.

Enterprise Use Cases

ThirdBrain's architecture — typed logical edges, absolute source traceability, and contradiction detection — maps directly onto high-stakes organizational problems.

• Absolute traceability from idea to code: Drop a PRD or domain doc — it's archived in raw/, decomposed into propositions with exact source spans, and linked to the development actions that implement them. The motivation link is your audit trail.
• Semantic collider: Ingest documents from two domains into separate folders and run a folder bridge (Mission Control → Explore folder bridges). conflicts_with edges reveal collisions before anyone writes code.
• Logical API gatekeeper: Build a master graph of core decisions. Ingest a new request; if it produces a conflicts_with edge against the master graph, the exact contradicted proposition is surfaced and resolution is demanded — by logic, not by exhaustion.

Requirements & License

• Obsidian 1.7.2+
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